در ضلع شرقی میدان نقش جهان مسجد دیگری بنا شده است به نام مسجد شیخ لطف الله که در دوران صفوی در قرن 11 ساخته شده است و از مشهورترین مساجد اصفهان میباشد معمار ان استاد محمدرضا اصفهانی بوده است و ساخت ان 18 سال زمان برده است .قصد شاه عباس از ساخت این بنا تجلیل از شیخ لطف الله میسی بوده است .تزیئنات این بنا همه از کاشی کاری و سقف ان از کاشی های معرق میباشد .از ویژ گی های این مسجد که باعث شده است با سایر مساجد متفاوت باشد این است که نه مناره دارد و صحن و شبستان .بخاطر اینکه این بنا مقابل کاخ عالی قاپو بنا شده است قادر به ساخت صحن برای اقامه نماز نشده است .